随着人们各大行业发展的不断进步，我们面临的是水质污染的问题。这么一来水环境监测已经成为了我们的“必修课”。现如今的水环境监测还存在什么问题呢？本章小编来和大家一起了解这个问题。可从以下三个方面来说：
1.职能交叉造成权责不明确
在我国的水环境监测工作发展中，不同的水体都是分别监管的，主要可以分为：饮用水、污水、废水、地表水、地上水等等，另外对于监管部门也不是单一的。这就可能会造成职能交叉管理，一旦没有安排好久会造成重复执行或是混乱的监测线路等情况。
在我国的水环境监测工作的发展过程中，按照不同的水体，分别进行监管，大体可以分为饮用水、污水和废水、地表水、地下水等，其对应的监管部门分别是城市建设、国土资源、环保部门、水利部门。以地下水一项为例，就有三个涉及的部门。很多的职能交叉是水环境监测管理工作中存在的重要问题，这就导致诸多部门的分工不明确，重叠的管理职能，造成了管理资源的浪费，以及混乱的监测线路和重复执行的监理工作。但是各个监管部门又是相互独立的，重复的劳动，使得资源的利用率得不到很大的提高。
2.指标选取不合理，做不到与时俱进
就目前情况来看，各大水系和城市很溜的污染已经从无机物污染转变成了有机物污染。但是实际工作，水质检察指标里有机物一项是综合性的项目，并不是有效具体的控制指标，对有机污染的严重程度，只在水质在线监测工程中并不能好的、及时的掌握，还阻碍了水质环境总量控制的目标实现。
3.监测分析技术方案不合适配现行的水环境质量标准
已经有多个项目记录了污染物的现行水环境质量标准和污水排放标准和当前现有的标准分析并不适配，而且没有形成好的水质分析方法。对于一些已经颁布的标准贯彻实施造成了不小的障碍，每一个检测项目尚缺少与之对应的最低要求的标准分析方法。