虽说随着我们的不断努力，水质监测工作已经取得了尽人意的成绩，但这不代表就没有问题的存在了。目前监测站网还没有覆盖所有地区，供水的企业是需要安装标准要求来完成相应的水质检测项目，由于多方面的因素，企业并没有完成所有指标的检测，那么为了有效的应对水质监测中存在的问题，需要从以下几个方面做起！
一、建立有效长期的水资源监测管理体系
我国的环境监测是属于同一个生态系统的流域是有多个部门管辖，这么一来就缺少对全流域范围内的整体考虑。一旦出现突发水质污染事件，这样就会涉及到水利、环保、交通、供水、城市建设和规划等多个部门，如果不是同层级的不能就很难做到一致。由此可见，建立长期有效的水资源监测管理体系尤为重要，明确监测机构和人员的职能，各大部门的任务分工明确，同时需要相互协助配合，确保检测数据的科学性与公信力，为开展水资源监督、评价、考核等提供好的条件。
二、开展水质预测研究
我国目前水质检测问题主要是以水质监测和水污染控制为主，对水质预测的分析研究还没有系统化。且自我国开展水质监测工作以来，累积了不少监测数据，监测成果并没有都被系统化利用。所以针对我们水质的监测现状及各种实验结果来分析，我们可以主要开展水质预测分析，包括不同河域、不同季节影响水质的各种因素，有准备的进行水质在线监测和水利应用，从而来提高水资源的服务能力。
三、增强投入的力度，提升工作人员的综合素质
我们知道水质监测行业是属于技术密集型的行业，涉及到的技术领域有多个，比如：电子、软件、机械等。这样是需要有经验累积才行的！还要以研发与技术人员推动行业的发展。这其实是目前该行业较为缺乏的，所以说增强投入力度，提升工作人员的综合素质尤为重要！我们要通过加强技术引导，加大对关键技术的投放力度，同时重视科研人的培养，增强监测队伍监测，提高监测人员的综合素质去推动水质监测行业的健康可持续发展。
四、第三方监测机构
就目前我国只有个别城市尝试数据监测方面引入第三方机构，很多地方还是会在当地环保部门内部安排相关部门进行监测工作，监测的质量各方面稳定性很难被公正监督，监测的过程如果存在问题也很麻烦。那么第三方机构监测的话，他可以保证检测结果真实可靠性！不过，对于第三方监测机构也是要加强监管的，避免供水的企业和第三方机构成立利益共同体。
五、公开对水质监测的信息
水质监测的信息公开，无可厚非这是公众的知情权、参与权和监督权。需要定期公布数据和分析结果，实现公众与相关部门的信息互动。这样有助于恢复民众对水质的信心，从而提高大家对相关部门的信任，也有助于强化公众参与和社会监督！