其中地表水水质监测站中配水单元的功能是将采水单元所采集到的样品根据所有水在线分析仪和设备的用水水量、水质和水压的要求分配到各个分析单元和相应设备。
系统将采水系统采集的源水分为两路，原水第一路直接进入多参数（温度、pH、溶解氧、电导率、浊度）流通槽；第二路经沉淀过滤后直接供给氨氮分析仪、总磷在线分析仪等仪器进行分析。两路原水的不同预处理方式能保证各分析仪表对测量水质的要求，既不失水样的代表性，又能对各类分析仪表起到保护作用。
配水单元包括流量和压力调节及系统清洗两个部分。其中流量和压力调节部分保证各分析仪表进水压力和流量满足其分析要求；预处理单元可以保证各水质分析仪表对进水水质的要求；系统清洗单元用于保证系统长周期稳定可靠运行。